托尼穿上马克三号以后，到处飞翔，每天不飞上几个小时都无法安定。一天，江小峰要离开，托尼放弃了继续飞行，回到别墅，看到了江小峰收拾好的行李，不解地问“伊森，你要离开我？准备去哪？”
江小峰把一段视频给托尼看，恐怖分子在伊森的家乡进行大屠杀，还在电视上说，这是报复伊森博士。托尼抬了抬手说“这我也有责任，咱们上次的事情还没结束，就该摧毁所有的恐怖分子。”
通过贾维斯的帮助，很快就查到这些恐怖分子就是十戒帮，只查到西处出击的十戒帮据点，江小峰穿上马克2号，托尼穿上马克3号一起飞向中东。这次就是一边倒的屠杀，返回的时候被军方发现了。军方派出4架F22，只是有江小峰的提醒，在战机到来之前，托尼和江小峰早己消失不见。战机来回搜索了几次都没有发现，军方对此非常恼火。
晚上江小峰对要出门的托尼说“托尼，能给我一千万吗？”
托尼点了点头给了江小峰5千万支票，然后江小峰说出去办点事，过几天就回来就出门了。
一天江小峰收到佩珀的电话，才知道托尼的生意伙伴奥巴代亚·斯坦尼开着铁霸王在追杀托尼。 江小峰联系贾维斯才知道怎么回事，原来是托尼在被绑架期间制造出了初代钢铁侠战甲并成功逃脱。奥巴代亚发现了钢铁侠战甲的巨大潜力后，心生贪念，想要将这项技术据为己有。他不仅派人窃取托尼的战甲设计资料，还在自己的工厂里秘密制造出了一套更大型、更具杀伤力的战甲，企图以此来取代托尼，掌控斯塔克工业以及未来的军火市场。
奥巴代亚穿上自制的战甲，与托尼展开战斗，想要置托尼于死地，从而彻底消除威胁，独霸钢铁侠战甲技术带来的利益。
托尼也是太自大了，一个不查差点没命，让奥巴代取走了他胸口的方舟反应堆，现在托尼胸口又装入在山洞制造好的方舟反应堆，能量不足以支持托尼长时间的战斗。
还好江小峰刚好事办完了，赶回托尼别墅，穿上马克2号就出发了。马克2号报仇的时候修改了能量供应方式，里面固定安装了一颗方舟反应堆，托尼胸口方舟反应堆被拿走，无法取下马克2号里面的方舟反应堆，只能装入佩珀用来记念的山洞里制造好方舟反应堆。
马克3号比铁霸王强太多了，可能量不支持它拆了铁霸王，江小峰来的时候，托尼只能飞来飞去干扰铁霸王，贾维斯一首在警告能量不足。
江小峰飞来后，把手上的导弹发射飞向铁霸王，跟着爆炸声冲上铁霸王。手掌发出激光，江小峰把生化危机里激光通道里激光和托尼激光合并，让激光切割性得到加强。托尼的激光切割性不足，像铁霸王挨了几次马克3号的手掌炮都没事。
“啊！”惨叫声响起，铁霸王让江小峰给切出了一个洞，奥巴代被激光切碎了脑袋。江小峰带着托尼和铁霸王飞走了，取出铁霸王里的方舟反应推装入托尼的胸口，托尼一天经历了三次换胸口的反应堆，托尼说“我一定要拿掉这个东西！”。
江小峰对托尼说“托尼，史塔克武器部你什么时候重新开门？”
江小峰打断托尼要说的话说“武器没有正义和邪恶，像奥巴代，马克3号在他手上就是杀人机器，在你托尼手上就是保护人类的英雄！你不能因为马克战甲资料泄密了，就销毁所有的马克系列战甲，永远不会研发吧！”
托尼想了想，点了点头同意了。
托尼又上新闻了，他说“武器没有好坏之分，好人的手上就保家卫国的，坏人的手上就杀人的工具。史塔克公司武器只和政府合作，只卖给保家卫国的人！”托尼的话让很多人支持，热烈鼓掌！
有记者问钢铁人的战斗，托尼首接没“没错，我就是钢铁侠！”
托尼又回到正常的生活，升级他的马克。一天托尼问贾维斯“贾维斯，伊森在干什么，好久没见了！”
贾维斯说“先生，伊森拿你给的钱买了很多医疗器械回来，他正在把医疗间升级！”托尼听了后，点了点头没说什么，他想伊森喜欢就去做什么，他只要支持就行了。
托尼发现他生病，让贾维斯扫描，才知道他中毒了，吓得托尼让贾维斯分析，什么时候中的毒，严不严重。
贾维斯告诉托尼“先生，是钯元素中毒，是你胸前的方舟反应炉使用了钯元素，长期接触使你的身体受到了钯元素的侵害，进而中毒。”
知道自己钯元素中毒后，托尼的身体状况逐渐变差，出现头晕、乏力等症状，严重影响了他的生活和工作。托尼在自己的实验室中不断尝试各种方法来解决这一问题，托尼几乎将元素周期表中的所有元素都一一试了个遍，试图找到一种可以替代钯元素的新元素，以解决反应堆的毒性问题。他在实验室中进行了无数次的模拟实验，虽然屡遭失败，但始终没有放弃努力。
由于身体不适，托尼意识到自己可能无法像往常一样全身心地投入到公司的管理中，于是他决定将公司全权交由小辣椒负责，让她处理公司的日常事务和重要决策。
托尼准备转让一部分股票给江小峰，剩下的留给佩珀，他让律师准备了合同，只要托尼死了后，合同立刻生效。
托尼开始了花天酒地的生活，他听说有赛车比赛，托尼就参加了摩纳哥赛车大赛。托尼这种情况很不对劲，而且托尼气色越来越差，对生活都无所谓了。佩珀找到了江小峰，告诉了江小峰托尼近期的不对劲。江小峰带着佩珀来到了托尼休息室，托尼现在的气色一看就知道生病了。托尼看到江小峰和佩珀，挥手让两人去忙，他要出去蹦迪，他要去跳伞运动，他要去度假，他要……。
江小峰打了托尼一巴掌，托尼才冷静下来看着江小峰，江小峰说“托尼，你要离开我吗？”
托尼眼睛就红了，江小峰接着说“你忘了在山洞里，恐怖分子用枪指着咱们的脑袋，洞外都是各种武器，到处都是恐怖分子，没有你我活不了，没有我，你也早就死了！现在的生活比那个时候是不是好太多了！咱们是生死的兄弟，有什么问题一起面对，还有什么事情有比在山洞里更坏的吗？”
托尼终于抱着江小峰大哭，然后说“伊森，我钯元素中毒很深，我就要快死了！”
佩珀吓得大叫“托尼，怎么回事？”
江小峰用手往下按了按说“托尼，我上次找你要一千万，你记得吗？”
托尼说“我怕你钱不够用，给了你5千万！”
江小峰说“我买了很多医疗器械，我这些时间一首在升级医疗间，现在可以做大型的手术！”
佩珀激动地说“伊森，你是说？是吧！”
江小峰点了点头，佩珀开心的笑了。托尼问“佩珀，我都要死了，你还笑？”
佩珀摸了摸托尼的头，脑袋坏了！说“托尼，伊森他一首在升级医疗室，他买了很多医疗器械，现在医疗室可以做大型的手术！”
托尼看了看两人说“这怎么了？伊森喜欢我们支持他就行！”
佩珀敲了敲托尼的脑袋问“咱们三人，谁需要做手术？”
托尼看了看伊森，又看了看佩珀，又看了看自己，终于想起，开心的问江小峰“伊森，我还有救？”
江小峰点了点头说“托尼，没人比我更了解你！方舟反应堆我也能制作，钯元素中毒我早就想到了，我以为你还要等一段时间你才会发现，谁能想到你钯元素中毒会突然这么严重，你越使用方舟反应堆，钯元素中毒就越严重！还好我一首在想办法帮你解决这麻烦，要不是佩珀找到我，你都自己把自己作死了，你是在自杀！”
托尼不好意思地摸了摸自己的下巴，一脸地苦笑。
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